植物DNA条形码：从基因到基因组
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发布时间：2015年01月12日
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植物DNA条形码技术在物种鉴别上效果显著，目前广泛应用于植物快速准确鉴定，但是目前尚未筛选出适合于所有物种的通用条形码鉴定序列。鉴于单位点DNA条形码序列在近缘物种鉴定中缺乏足够的变异，随着测序技术的进步，近年来的条形码鉴定研究把重点寄希望于采用叶绿体全基因组序列开展物种鉴定。然而，尽管叶绿体基因组测序可以提供具有充分变异的“超级条形码”用于物种的准确鉴定，但测序成本相对高昂且鉴定速度远低于单位点条形码，同时对于一些不具备叶绿体基因组高通量测序的实验室是十分困难的。在对单位点DNA条形码候选序列优劣势分析的基础上，本文对采用“超级条形码”开展植物鉴定的可行性进行了综合评价。对于目前DNA条形码难以鉴定近缘物种的困境，本文提出了一种新的解决策略，即针对于既定植物类群，在叶绿体基因组测序的基础上筛选“特异条形码”，该条形码在开展物种鉴定时结合了单位点条形码鉴定速度快和超级条形码变异位点多的优势，可有效应用于种及种下分类等级的植物鉴定。
上述研究结果发表于Biological Reviews. Article first published online: 25 MAR 2014 DOI: 10.1111/brv.12104, 1464-7931. Plant DNA barcoding: from gene to genome.
陈士林课题组供稿
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